События Martyr разворачиваются в 41 тысячелетии и повествуют о древнем корабле-призраке, который выходит из Варпа в реальное измерение и тут же привлекает к себе повышенное внимание. Вскоре выясняется, что пустые и заброшенные палубы корабля осквернены силами Хаоса, и тогда Инквизиция посылает туда одного из членов Ордо Маллеус — ордена, специализирующегося на уничтожении демонов.

Особенности игры:

Глобальный режим. Игрокам будет доступен глобальный режим Inquisitorial Campaign, который представляет собой своего рода мультиплеерную «песочницу». А именно: каждый свободно путешествует по галактике (Sector Caligari) на корабле-крепости со своими напарниками и выполняет различные миссии в случайно генерируемых локациях.

Кооператив. Помимо одиночной и глобальной игры, Warhammer 40,000: Inquisitor – Martyr будет включать кооператив на четверых игроков — при желании роли напарников Инквизитора возьмут на себя не боты, а живые игроки.

Сила выбора. Каждая миссия, имеет последствия для всех остальных, то есть для всего сектора. Иными словами, отдельный выбор каждого составляет выбор всего сообщества на уровне «метаигры».

Классы. Игрокам представится возможность выбирать из трех классов персонажей. Один из них - крестоносец, аналог воина, напичканный аугментациями и генными модификаторами. Про два других пока известно только то, что один из них — псайкер, а другой — женщина. У каждого класса в Inquisitor — Martyr по три подкласса.

Тактические сражения. В Warhammer 40,000: Inquisitor – Martyr можно будет использовать укрытия и точечно отстреливать своих врагов, в особенности, крупных существ, лишая их некоторых способностей или даже оружия. Кроме того, периодически будет возможность использовать транспортные средства — разработчиками обещаны, в том числе, автомобильные сражения, обставленные как мини-игры.

Выбор оружия. Martyr вобрал в себя не только способности и умения из оригинальной настольной игры, но и некоторые фирменные виды оружия, такие как болт-пистолет, цепной меч и плазменная винтовка, которая перегревается при длительном использовании (но не взрывается).