Добрый день, Наталья!
Тут все зависит от степени неровности плитки. Если она просто шероховатая, то это не повлияет на степень приклеивания. Если же она имеет скосы, то тут надо понимать их глубину. Приложите к плитке линейку, к примеру, и посмотрите, насколько велики зазоры между кафелем и линейкой. В эти зазоры можно выдавить больше клея, но тут решите для себя эстетический вопрос того, что будет зазор между стенкой полочки и кафелем.