Добрый день.
Трубку под термометр можно использовать для установки термометра или щупа автоматики или можно заглушить если вас не интересует температура в нижнем узле отбора. Термометр можно спользовать любой с десятыми долями градуса, для более точного измерения изменения температуры, диаметром щупа не более 5,8 мм. По температуре в нижнем узле отбора можно судить о количестве хвостовых фракций в испаряемом спирте, с ростом температуры будет увеличиваться количество тяжелых фракций. Ставить или не ставить термометр каждый решает сам, но контролировать процесс при наличии измерительного прибора проще.